Κάθε ακαδημαϊκό έτος αρχίζει την 1η Σεπτεμβρίου και λήγει την 31η Αυγούστου και περιλαμβάνει δύο (2) αυτοτελή εξάμηνα 15 εβδομάδων το καθένα. Το χειμερινό αρχίζει στο τρίτο δεκαήμερο του Σεπτεμβρίου και λήγει μέσα Ιανουαρίου. Το εαρινό αρχίζει στα τέλη Φεβρουαρίου και λήγει στα τέλη Ιουνίου. Στο τέλος κάθε εξαμήνου παρεμβάλλεται εξεταστική περίοδος.
Μαθήματα δεν πραγματοποιούνται τις εξής μέρες: Εθνική γιορτή της 28ης Οκτωβρίου, 17η Νοεμβρίου, 12 Δεκεμβρίου, Εορτή του πολιούχου της Πόλης της Ναυπάκτου Αγ. Δημητρίου. Τις διακοπές των Χριστουγέννων από 24 Δεκεμβρίου έως 2 Ιανουαρίου, τα Θεοφάνεια, Εθνική γιορτή 25η Μαρτίου, Καθαρή Δευτέρα, τις διακοπές του Πάσχα από την Μ. Τετάρτη έως Τετάρτη του Πάσχα, 1η Μαΐου, τις διακοπές του καλοκαιριού από 6 Ιουλίου μέχρι 31 Αυγούστου. Οι ακριβείς ημερομηνίες έναρξης και λήξης των μαθημάτων, καθώς και οι ημερομηνίες των εξετάσεων, καθορίζονται από το Συμβούλιο του Τ.Ε.Ι. Μεσολογγίου και ανακοινώνονται κάθε Ιούνιο.